隨著醫改的不斷深入，很多大中型公立醫院通過聯合兼并等模式成立了醫院集團。由于我國沒有出臺相關法律來規范這一行為，目前醫院集團化管理存在較多問題，尤其在財務管理方面問題頗多，制約了醫院集團的健康有序發展。吉林大學中日聯誼醫院通過實行財務集中管理、統一核算的集團化財務管理模式，實現了集團化醫院科學、高效的財務工作模式，加強了集團化醫院財務管控力度。其主要做法包括：
一是撤銷各院區財務機構，實行財務集中管理、統一核算的集團化財務管理模式。醫院只設一個基本賬戶，將一切收支活動全部納入財務部門統一核算和管理，執行統一的財務規章制度，統一籌劃調配醫院資金，院區的經營情況通過輔助核算實現。院區的人事、采購、醫保、后勤等部門垂直管理，通過合理調配人流、物流、資金流資源，實現了各院區協同發展，提高了醫院的核心競爭力和醫院整體運營效益。
二是加強財務信息系統建設，提升財務信息化水平。借助信息化手段優化預算管理流程，建立會計平臺系統，實現醫院財務網絡化管理；開展網上報銷業務，實現醫院財務集團化管理；構建預算、核算、決算一體化財務管理體系，運用信息化手段加強財務分析工作，提高財務分析水平；構建財務風險預警控制系統，有效管控財務風險。
三是以財務流程再造帶動工作效率的提高。構建一體化財務信息共享平臺，建立“一個機構、一個賬簿、一個賬戶”的核算體制和運營機制，統一財務職能，明確經濟核算和財務管理范圍，通過全方位的憑證管理、全過程的財務監督、全要素的成本核算運行模式，實現財務管理集團化管控目標。
