我國1999年1月開始實施的《醫院財務制度》和《醫院會計制度》，對規范醫院財務行為、加強醫院財務管理，以及如何提高資金使用效益具有重要影響。但是隨著公共財政框架的建立、社會主義義市場經濟體制的逐步完善以及各項財政制度的不斷深入，醫療機構的運營體系也發生了變化，經濟活動也發生了變化：更加多樣、復雜?！蛾P于深化醫藥衛生體制改革的意見》（中發〔2009〕6號）中明確指出，將對醫院各項體制、機制進行改革；并盡快完成多元化辦醫格局建設。為此，醫院必須嚴格控制醫院預算、加強收支管理、加強成本核算和控制，實行醫療服務成本核算，對醫院服務效率進行科學考評;并對醫院信息進行全面公開，并接受整個社會監督。2012年元月實施的新的醫院財務會計制度，對實施財務制度的進一步管理、監督和運行都具有十分重要的意義。
一、強化成本控制，促進醫院科學管理，提高醫院在醫療市場中的競爭力
醫療衛生體制的改革需要醫療體制的不斷深化輔助，改革政策重新對醫院管理方面衛生提出了的要求。醫改方案指出，要嚴格按照制定的計劃對醫療服務進行成本核算，測算。對醫療服務效率進行科學考評。衛生部門、財政部門等有關管理部門也針對醫院管理提出了適應當前改革發展的要求，加強醫院成本控制，以人為本，努力解決“看病困難”、“看不起病”等問題。強化成本控制，早日實現 “優質的醫療服務、低廉的醫藥費用”的衛生改革目標。
醫院通過成本分析與核算，提出成本控制措施，降低其活動成本。成本管理能夠真實、準確、全面地呈現出醫院成本具體情況，加強成本控制，實現降低醫療成本，達到提高醫院績效，增強醫院競爭力的目的。成本管理是成本核算、分析、控制等各方面有機組成。
實行全成本核算，可以為價格主管部門制定醫療服務價格提供參考依據，為醫保方單病種付費提供相關成本信息，為醫改政策制定提供數據支持。
實行全成本核算，促進醫院各級管理更加科學化、規范化。一方面，通過全成本核算，促進醫院加強藥品、衛生材料、房屋、設備固定資產等各項基礎管理，另一方面，分析成本核算提供的成本數據并將其作為醫院對科室考核的重要依據，組織各核算單位充分全面利用各科室人員、資金、設備等要素進行經營，完成提高效益、提高競爭力的目標。
實行成本核算，有利于增強全員成本意識，建立節藥型醫院；促進醫院人員、資金、設備的合理配置，提高醫院資金充分使用率；施行績效考評，把員工工作積極性調動起來。
新財務制度對成本管理的要求及目標等提出了明確要求，使醫療成本歸集核算體系更為精確，重點對醫療成本的分攤與核算提供了一致、可驗證的基礎數據。主要體現在：固定資產的折舊，攤銷無形資
產的成本范圍使財務成本更加全面、真實;規范了相關行政后勤科室、醫療輔助科室、醫療技術科室、臨床服務科室的成本核算方法、依據科學的方法對成本進行歸集、分配并通過成本報表反映出來，將成本報表作為編制財務報告時財務情況說明書的一個附送內容;將藥物收支納入醫療費用的統一核算，藥物費用按實際購買價格計量的消費，作為醫療成本的一個構成部分，把醫療費用，更具體、清晰地呈現出來,更符合配比原則。
二、實行全面預算管理，強化政府監督，防止財務危機
新財務制度提出對醫院采取“核定收支、結余按規定使用、定項補助、超支不補”的預算管理制度，把預算核算指標更精確化，對財政資金的考核更加嚴格，分開核算基本補助、項目補助收支，分別計算，為財政支出使用效果提供有效評價依據，使財政支付更透明化、規范化。
加強醫院預算管理與規范，預算管理把醫院所有收支包含在內，使預算更具完整性，嚴肅性,杜絕自由調整項目支出等不規范問題，早日實現醫院標準化運營。
充分明確醫院總體預算管理方法并和財政預算管理體制改革相連接，明確新系統預算管理的每一個環節，對醫院預算各個環節的原則、程序等作出相應規定。同時對在預算管理過程不同部門（主管部門、財務部門等其他相關部門）的職責進行明確。
三、真實反映資產負債信息，強化管控手段，促進科學決策
新財務制度規定，醫院要全面真實核算所擁有的的資產和負債，披露資產真實負債信息，包括在會計核算時基建并入大賬、提取醫療風險金、壞賬準備金、財務報告時編制現金流量表等。
四、實行總會計師制度，標準化醫院財務管理體制
(一)實行總會計師制度
新財務制度規定，三級醫院應設置總會計師?？倳嫀熥鳛獒t院領導成員，協助醫院管理層（院長）工作，對整個醫院負責，與醫院領導同共分析醫院經濟情況，考慮其發展，貫徹醫院“統一領導，集中管理”的管理體制，更有利于經濟決策的制度化、規范化、專業化，有利于加強醫院財務運行的的監督管理。
(二)規范醫院財務信息準確性，提高財務數據的可用性，加強財政預算資金和科教資金使用監管
新財務制度全面清晰地反應出醫院總資產規模、固定資產凈值、國家資本投入的利用成效，界定新的收支分類及其標準、規范財務報告，使醫院財務信息更為精確。加強科教資金使用監管和財政預算資金，為財政補償機制的建立提供了財務依據。待沖基金等財務信息反映出國家財政資金投入與資金消耗動態，對醫院基本建設和設備購置再投入的財政研究方面和補償制度提供了可靠的財務信息。
(三)完善財務報告體系，全面滿足多方面的財務信息需求
新財務制度增加了收入支出表、財政補助收支情況表、現金流量表以及成本報表等，更加完善了醫院的財務報表體系，將醫院各項財務信息全面、準確地傳遞，使每位使用報表的人員全面準確了
解醫院的財務情況，對醫院的經營活動和績效給予正確的評價。
五、引進注冊會計師審計制度，增加醫院財會信息公信力
注冊會計師利用所具備的專業知識及工作經驗，對醫院財務報告進行精確審計，審計完成并發表審計意見，協助醫院完整核算，準確計量收入、支出，增強醫院會計信息的質量、透明度和社會公信力。
六、轉變醫院經營管理模式，明確職能定位，維護公益形象
新制度明確規定醫院是公益性事業單位，不允許有盈利性的內容體現；但是醫院如果只注重服務，忽視效益，不計成本這并非實質上的公益而是一種變相資源浪費；只有提高資金使用效益，加強成本核算，醫院才能持續提供高質量、價格合理的服務，這關系到患者的經濟情況和醫院生存發展。因此，醫院財務具有財務管理的專家，熟知現行財經制度、法規、擅長運用先進的理財手段，對于經營和管理醫院及保障醫院持續穩定發展起著不可或缺的作用。同時促進醫院醫療服務行為規范化，維護醫院社會公益性；確保醫改資金使用的公開化，保證規范、安全，保證財政醫療衛生資金支出的公益效果。
新制度有利于醫療機構加強財務管理和會計核算，確保財政資金使用安全、透明；加強醫院風險防范意識，增強防御財務風險和經營風險能力，同時建立健全的醫院風險評估機制、制定健全內部控制制度，充分發揮注冊會計師審計鑒證職能，有效防止控制醫療腐敗現象。但在新制度中對科室成本的控制、多種辦醫模式下資本籌集業務、公益性收支的核算等方面還需要進一步完善。
