一、目前經濟責任審計工作中存在制度方面的風險
首先，經濟責任審計法律、法規不完善帶來的審計風險。這幾年的經濟責任審計工作，主要依據兩個暫行規定來開展審計工作。審計人員在開展經濟責任審計工作時，對這兩個暫行規定的理解和操作已經駕輕就熟。因此，我認為，對黨政領導干部和國有企業及國有控股企業領導人員經濟責任審計的立法時機已經基本成熟，應盡快在“兩個暫行規定”的基礎上進行修改，將其上升為法律或法規；對經濟責任審計的對象、程序、內容、方法、評價的內容和標準、審計結果報告的運用等進行明確的規定，以使經濟責任審計工作有法可依，便于操作，從而減少和防范審計風險。
其次，不同崗位領導干部經濟責任的評價指標體系模糊帶來的審計風險。隨著我國國民經濟的高速增長和政治體制改革的不斷深入，經濟責任審計工作總量越來越大，情況也越來越復雜。從我省各地經濟責任審計工作的進行情況來看，由于每個審計人員理解的不同，審計水平的不同，會出現不同的審計評價。因此，要盡快確定不同崗位領導干部的經濟責任，為經濟責任審計提供確實可行、易于操作的審計標準和評價標準。例如，在政府職能部門工作的領導干部經濟責任應該是什么；鄉鎮黨委書記和鄉鎮長，縣委、縣政府領導的經濟責任應該是什么，兩者的責任怎樣劃分；黨的部門的領導干部經濟責任應該是什么；指標體系評價標準是什么等，要有明確的、細化的規定。通過明確具體的經濟責任和指標體系、評價標準來防范審計風險。
再次，經濟責任審計承諾制度缺失帶來的審計風險。建立經濟責任審計承諾制度，正確區分會計責任和審計責任，既有利于保護審計人員縮小其承擔責任的范圍，也有利于被審計人員和被審計單位會計核算和財務管理行為的進一步規范化。在審計實踐中，往往由于領導干部和財務人員的變動，出現互相推諉、審計承諾缺失的情況。因此，在審計前要求被審計人員、被審計單位及其財務負責人或主要負責人，對提供的會計資料和其他資料的真實性、完整性作出書面承諾，是防范審計風險的好措施。當前在許多審計機關實行的審計承諾制，由于在法律法規上沒有明確的規定，在要求被審計單位和被審計人員進行承諾時，沒有強制性的約束力，隨意性也比較大，所以要明確建立承諾制度，借以防范和降低審計風險。
最后，無法充分發揮經濟責任審計聯席會的作用帶來的審計風險。經濟責任審計的一個顯著特點是工作涉及面較廣，從經濟責任審計領導小組的設立就可看出與組織人事部門、紀檢監察機關、國有資產管理部門的聯系非常密切。因此，明確“經濟責任審計聯席會議”的職責，使其充分發揮作用是當務之急。一方面，經濟責任審計聯席會議要交流、通報領導干部任期經濟責任審計情況，研究解決領導干部任期經濟責任審計中出現的問題；另一方面，聯席會議要積極推進經濟責任審計的環境建設，加強對經濟責任審計的宣傳，正確定位對經濟責任審計的期望值。開展經濟責任審計是為了加強對領導干部的監督管理，促進黨風廉政建設，從源頭上加大預防和治理腐敗的力度。另外，還應通過聯席會議，解決經濟責任審計中的一些實際問題，審計中遇到責任不清，難以評價的問題，要及時向有關部門反映情況，求得他們的幫助。通過立法確定經濟責任審計聯席會議的職能，充分發揮經濟責任審計聯席會的作用，降低和防范審計風險。
二、經濟責任審計管理方面的風險
第一，強化審計項目管理，規范審計實施程序。
經濟責任審計是一個由多環節組成的工作過程，其中任何一個環節的失誤均會導致審計風險。當前，經濟責任審計工作時間緊、任務重，特別是市、縣兩級審計機關由于大面積換屆等原因，造成審計工作任務繁重，審計人員壓力過大的現象。為此要加強審計項目管理，在每一具體環節上都要注意避免產生差錯，控制審計風險。一是要嚴格按照《審計法》規定的內容實施審計，二是要嚴格按照《審計法》規定的審計程序實施審計，并注意把好以下幾個關口：
1.確定好審計方案。組成審計組后首先要編制審計方案，要編制好審計方案必須進行審前調查。審前調查的主要目的是為了確定經濟責任審計的重點，并對審計風險進行合理預測。根據審前調查發現被審計單位的薄弱環節和傾向性問題，確定審計重點。根據被審計人員任職期間所在單位的財政財務收支以及企業資產、負債、損益的真實合法情況，恰當地給予評價。
2.把好審計實施關。審計人員在實施審計過程中，要選準風險控制的關鍵點，對容易引發風險的關鍵點進行嚴密控制，提高審計質量和審計工作效率。
3.把好內部控制審計關。在經濟責任審計中，要把被審計單位的內部控制制度作為一項重要審計內容，它不僅可以使審計人員全面地了解被審計人員工作職責的履行情況，并且可以查找被審計單位管理中的薄弱環節，幫助該單位強化內部控制制度建設，加強內部管理。
第二，強化審計人員培訓，提高審計人員政治素質和業務水平。
提高審計人員素質是搞好經濟責任審計的關鍵。審計人員是經濟責任審計工作的具體執行者，審計人員的政治素質和業務水平的高低直接關系到經濟責任審計項目質量的好壞和審計風險的大小。因此，提高審計人員的自身素質，對控制和防范經濟責任審計風險，提高審計質量有著根本性的作用。首先，要在經濟責任審計立法中確定經濟責任審計人員必備的政治素質和業務水平，為進行經濟責任審計配備高素質的審計人員；其次，加強經濟責任審計人員的職業道德素質培養；再次，強化審計人員的業務培訓，使其不但有較高的職業道德，還具有較高的審計業務水平，能從大局上把握整個經濟責任審計；最后，強化經濟責任審計人員的風險意識，只有時刻牢記審計風險，才能把經濟責任審計的風險盡可能地控制在最低限度
