一般而言，企業的研發支出被記入期間費用，從而影響當期損益。2010年，滬深兩市多數科技型上市公司的管理費用同比上升，一大原因便是研發投入加大。從短期看，這些公司研發費用的增加會對整體業績造成負面影響；不過，從中長期看，一旦研發進程進入“開發”階段，那么前期的研發支出將被“資本化”以抵扣企業所得稅，并直接增厚業績。同時，正當而有效的研發投入也必將增強企業的核心競爭力。
根據《企業會計準則第6號——無形資產》規定，企業內部研發項目的支出，應當區分研究階段支出與開發階段支出。研究費用依然是費用化處理；進入開發程序后，對開發過程中的費用如果符合相關條件，就可以“資本化”。
會計專家指出，前期的研發支出費用化處理，往往導致有關上市公司、尤其是研發密集型公司的價值被低估。一旦部分研發支出被“資本化”處理，相關企業將增加無形資產，財務狀況也會有一定程度的好轉。
除“資本化”以外，根據2007年出臺的《企業所得稅法》及《企業所得稅法實施條例》，企業研發費用還可按實際發生額的150%抵扣當年度的應納稅所得額，對于開發新技術、新產品、新工藝的研發費用，還允許加計扣除（在原有100%的基礎上再加一個比例）。這相當于一種減稅行為，因此，對企業利潤和經營業績是正面的影響。
以亨通光電[33.86 0.15% 股吧]（600487）為例，2010年公司實現主營業務收入20.85億元，比上年同期增長10.49%；實現營業利潤2.17億元，同比下降12.76%；實現凈利潤1.63億元，同比下降11.49%。該公司的管理費用上升是拖累盈利能力下降的重要原因。
去年亨通光電管理費用率同比增加3.49個百分點，達到10.37%，并帶動期間費用率增加了4.32個百分點，達到18.08%。而管理費用的增長主要原因是公司為推出新產品而加大了研發投入，研發費用同比增幅達108.6%。業內人士認為，公司的研發戰略雖然在短期內影響公司的盈利，但自主創新技術將提升今后的產品毛利率，并最終提高盈利能力。
2010年，創業板上市公司通過研發投入來增加核心競爭力的愿望十分迫切。已披露年報的公司中，超過八成的公司研發費用同比增長，近三成公司研發費用增幅超過50%。對于管理費用的描述，大多數創業板公司稱“較上年增長變動較大主要原因為加大了研發項目的投入”。
從占營業收入比重來看，專注于銀行影像應用軟件領域的銀之杰[35.73 -0.14% 股吧]（300085）2010年研發費用占營業收入高達20.6%，主要提供視頻會議、視頻監控、遠程醫療、遠程定損等多媒體通訊方面產品的華平股份[37.72 -0.55% 股吧]（300074）這一比例也達到了11.88%。
不過，市場人士也指出，研發投入也可能成為相關公司調節利潤甚至規避稅收的手段，這值得警惕。在實際情況中，開發和研究很難區別，不同的分類就有可能造成對利潤表影響的時點變化不同，因此也給相關公司帶來很大的利潤調控余地。另外，由于存在所得稅抵扣，上市公司很可能“虛增”研發費用，這種情形顯然對企業的長期發展不利。
