新醫院會計制度自２０１２年１月１日起將在全國施行，各地醫院會計實務工作者需要面對的將是不小的挑戰。
北京同仁醫院財務處處長侯常敏告訴《中國會計報》記者，“制度設計本身已經相對完善，但通常在實務操作中則需要考慮更多的東西，醫院需要做好準備工作以適應新制度?！?資產盤查、處理應走在前面
侯常敏認為，雖然新制度開始實施的時間在明年，但實務中需要做很多準備工作，不能等到年底決算出臺后再來進行，否則會出現賬目不易銜接的問題。
如新制度中明確提出對固定資產計提折舊，而在對固定資產計提折舊之前，對醫院資產進行盤查、處理則顯得非常必要。
清點資產需要保證賬實相符，侯常敏特別指出，賬實相符的“實”，不僅是數量上的“實”，還是質量上的“實”。
這種質量上的“實”，首先體現在資產的成新率。醫院財務人員需對固定資產的折舊進行追溯調整，否則在對固定資產計提折舊的實務操作中，可能出現無法結轉的情況。
固定資產的在用狀態則是質量上的“實”的另一方面。
新制度在對固定資產的規定上更加體現出精細化管理，不在用的固定資產則需單獨反映。一般情況下，在用的固定資產應歸入 固定資產科目進行核算，不在用的部分，或許因為報償手續沒有完成等原因，這份實際上已不屬于資產的部分仍被放入固定資產，只有在明確了這部分資產后，“固定資產清理”科目的會計核算才能進行。
除資產外，新制度對于基金科目的調整較多，各基金內涵也不同于以前。因此在新的科目使用之前，醫院財務人員需逐項核對基金，找到被取消的基金取消之后相對應的科目，從而對凈資產進行進一步清理。
改進信息化軟件
在財務管理工作已經實現電算化的今天，一套完整的可操作的方法對會計信息化軟件也提出了相應要求。
從業務處理上，單是對固定資產計提折舊的問題，信息化軟件就需進行不少的重新設置，以滿足固定資產計提折舊時出現的不同情況，從而保證其計提折舊的準確性。
信息系統需要能夠區分出固定資產計提折舊的具體情況。如醫院的圖書不計提折舊，已經提足折舊并且仍在使用的固定資產也無需計提折舊，信息系統需要給出足夠準確的判斷。同時，由于形成固定資產的資金來源不同，在計提折舊時的具體口徑以及相關的對應科目也并不一樣，這些都需要計算機重新進行分類處理，設置固定資產核算的相關功能。
此外，財政補助資金中的基本支出需要在年末進行收支結轉，其余額不得參與結余分配。由于在年度運營中無論是使用財政補助資金基本支出經費還是醫院自有資金， 支出發生時都通過“醫療業務成本”、“管理費用”等科目核算，這就需要在日常會計核算時建立電子備查簿。與此相對應，信息系統中也需要設立相應模塊。
而在具體工作中，科教項目由之前的專用基金管理或往來管理變成了收支管理，為了避免需要等到月末結算時才能得知科教項目結余這種情況，需要通過備查簿來進行結余的實時情況查詢，如此一來日常工作才能更加順利進行。
內部控制則更是需要考慮的部分。內部控制在手工階段與電算化階段有各自不同的措施，而新制度推行后，除了電算化固有的措施外也需要制定一套稽核方法，保證會計處理的準確和完整，從而把各個環節的稽核工作和勾稽工作做清楚。
會計改革將對“人”提出挑戰
新制度有很多創新，同時它們也是執行中的難點。如在尊重資金來源多樣性的同時又保證資產管理的一致性，新制度采用“待沖基金”來解決這個問題。諸如此類的會計處理還有很多。
國家中醫藥管理局規劃財務司副處長王振宇說，“這就需要醫院會計人員不僅認真領會制度精髓，掌握新舊制度的差異、做好新舊醫院會計科目銜接、調整，還要適應新制度及隨之而來的后續管理理念、體系、方式、方法等各種變化?！睘閷崿F這個目標，培訓和學習可能是必經之路，尤其是醫院的會計骨干要整合資源、帶好團隊，帶動新制度的有效實施。
