2016年7月，國家把原農作物良種補貼、種糧直補、農資綜合補貼等農業三項補貼合而為一，統一改稱“農業支持保護補貼”。同時，專門將原農資綜合補貼的20%資金專門拿出來用于支持糧食規模生產。
一、農業三項補貼的實施情況
2002年起我國對大豆主產區黑龍江、吉林、遼寧、內蒙古實行農作物良種補貼。2009年起對全國小麥、玉米、水稻、棉花等實現普惠式農作物良種補貼。2004年起改變過去統購統銷、補貼糧食流通企業的做法，對種糧農民實行直接補貼，同時，對購買特定農業機械設備的農戶實施了農機購置補貼。2006年起又增加了農資綜合補貼。農作物良種補貼、種糧直補、農資綜合補貼成為新世紀以來我國農業補貼的主要組成部分（見表2）。
三項補貼設置本意促進糧食生產，補貼辦法有按照農戶計稅面積（農村稅費改革確定的面積）、農戶計稅產量（農村稅費改革確定的產量）及農戶實際糧食種植面積三種標準發放。實際操作中，由于6億農民面廣量大，同時要求在較短時間內完成發放，一般操作中基本按照農戶計稅面積發放，很少考慮農戶產量及農戶是否實際種植，有承包土地就有補貼。實際上變成了一種普惠式補貼。對于承包土地轉包給他人的，實際上土地流轉后三項補貼仍發給原土地承包戶，相應的土地流轉農戶并未能享受到農業三項補貼。
二、農業三項補貼實施中存在的問題
1.我國農業三項補貼對于農民收入貢獻不大，特別是在經濟發達地區效果更是有限。我國農業三項補貼呈現逐年上升態勢，特別是農資綜合直補力度不斷加大。但是人均補貼額在最高年份占農民人均純收入的3.3%，平均只占人均純收入的1.9%，對農民增收貢獻有限。
2.我國農業三項補貼并未與糧食產量（規模）直接掛鉤，不利于穩定糧食生產，不利于促進規模經營。考察世界發達國家的農業直接補貼，不管是掛鉤或非掛鉤，糧食產量都是農業補貼一個重要評價依據。農業補貼與糧食產量掛鉤，對一般農戶影響不大，受影響最大的是專業大戶等規模生產經營主體。從歐盟的情況來看，大農場主人數僅占農民的5.6%，因其土地規模大、產量大獲得歐盟近一半的農業補貼，大大提高了其生產積極性與農業現代化水平。
表2 我國農業三項補貼資金及其占農民人均純收入的比例 （單位：億元/元/%）
年份 糧食直補總額 農資綜合
直補總額 農作物
良種補貼 合計
總額 人均補貼 人均
純收入 人均補貼占
人均純收入比
2002 1 1 0.2 2476 0.008
2003 3 3 0.5 2622 0.01
2004 116 32.4 148.4 24.7 2936 0.8
2005 116 41.4 157.4 26.2 3255 0.8
2006 142 125 43.4 310.4 51.7 3587 1.4
2007 151 276 58.4 485.4 80.9 4140 1.9
2008 151 482 109 742 123.7 4760 2.6
2009 151 716 154.8 1021.8 170.3 5153 3.3
2010 151 716 154.8 1021.8 170.3 5919 2.9
2011 151 835 154.8 1140.8 190.1 6977 2.7
2012 151 835 154.8 1140.8 190.1 7917 2.4
2013 151 1071 154.8 1376.8 229.5 8896 2.6
2014 151 1071 154.8 1376.8 229.5 9892 2.3
2015 160 1305 154.8 1619.8 269.9 10772 2.5
三、農業支持保護補貼的改進方向
農業三項補貼之所以效率不高，主要原因為現行普惠式的補貼重在公平，原則上只要有承包土地的農民都進行補貼，未能重點惠及從事規模生產的新型農業經營主體，其直接的政策后果就是糧食生產遠未實現適度規模經營，同時龐大的農村人口決定了普惠式農業支持必然面臨“僧多粥少”的財政困境和激勵難題。因此，未來農業支持保護補貼改革的重點不應是價格支持，而應該是在提高補貼效率方面下功夫，關鍵在于通過政策帶動發揮新型農業經營主體和糧食主產區的比較優勢，從根本上提升我國農業的國內外競爭力。這樣，一方面，不必面臨補貼總額連年上漲的財政剛性壓力，另一方面，只要保持補貼適度的穩定增長，就可以穩定糧食生產，實現規模經營。
