一、獨立核算與非獨立核算的區別
獨立核算或非獨立核算屬于稅務上的規定。一般情況下，在當地負有流轉稅納稅義務，即需要登記為獨立核算性質分公司。也即是說，在當地從事經營活動的，就需要登記為獨立核算性質。
分支機構在當地不從事經營活動，只是負責聯絡、售后服務等業務，在當地不涉及流轉稅的繳納，可以登記為非獨立核算性質。
因此，判斷的關鍵在于分公司是否從事經營活動（銷售貨物或提供應稅勞務），是否在當地繳納增值稅或營業稅。
分公司為非法人資格，不可能取得法人資格營業執照。獨立核算或是非獨立核算與這個沒有關系。營業執照里面的經營范圍可以作為判斷在當地是否從事經營活動的依據。
非獨立核算的分公司可以領用增值稅專用發票，但前提是總公司也是一般納稅人。
▲▲二、非獨立核算方式下的會計科目設置
通常情況下，企業依據相關會計制度及規定對會計科目予以設置。現階段，國內經濟市場中現存會計科目已多類，包括“經費支出”科目、“基本建設支出”科目、“事業支出”科目、“其他資本性支出”科目等，具體內容體現為：
（一）“經費支出“科目
行政單位置于“經費支出”科目的“項目支出”二級科目下，以科學合理性原則為指導，結合企業實際發展狀況實施預算撥款活動，并構建“基本建設支出”與“其他資本性支出”三級會計科目，由其負責對基建投資開展會計核算活動，即在“基本建設支出”三級會計科目中核算由行政單位所安排的用于企業建設項目支出的資金，而在“其他資本性支出”三級會計科目中核算其他單位所安排的用于企業建設項目支出的資金。
（二）“事業支出”科目
事業單位置于“事業支出”科目的“項目支出”二級科目下，以科學合理性原則為指導，結合企業實際發展情況實施預算撥款活動，同時構建“基本建設支出”與“其他資本性支出”三級會計科目，由其承擔對基建投資開展會計核算職責，即在“基本建設支出”三級會計科目中核算由事業單位所安排的用于企業建設項目支出的資金，而在“其他資本性支出”三級會計科目中核算其他單位所安排的用于企業建設項目支出的資金。
（三）“基本建設支出科目”與“其他資本性支出”科目
與“基本建設支出”科目相比，“其他資本性支出”科目的核算內容大致相同，但其也存在部分方面有所不同。一方面，項目投資安排主體不同。對于前者，其主要核算行政單位或事業單位所安排的財政預算資金，而后者主要核算除行政單位或事業單位之外所安排的財政預算資金；另一方面，土地費用處理方法不同。對于后者，其下可增設“土地補償”科目、“地上附著物與青苗補償”科目、“安置補助”科目及“拆遷補償”科目等，而前者不存在負責土地補償費用核算的相關科目。
▲▲三、非獨立核算方式下的賬務處理方法
基于企業未明確是否推行國庫集中支付，為此非獨立核算方式下的賬務處理方法存在較顯著差異。具體如下所示：
（一）國庫集中支付方式下的基建核算
實際上，國庫集中支付背景下開展會計核算活動過程中未涉及到項目建設資金的直接撥款收入業務，僅能夠表明項目支出核算業務，若從會計處理層面看，既能夠反映出支出又能夠反映出撥款，其中借記“經費支出——項目支出”科目，貸記“預算撥款——國庫直接支付”科目。另外，根據行政單位核算要求，可借記“固定資產”科目、貸記“固定基金”科目，如此以來不僅能夠充分揭示出基建投資實際狀況，而且還為相關部門實施基建項目竣工財務決算編制活動提供了信息支持。至年末，企業應將存入國庫的項目結余資金確認為正常國庫結余資金予以處理，其中借記“財政應返還額度”科目，貸記“預算撥款——財政直接支付”科目；至下年度，運用上年結余資金時，借記“經費支出——項目支出”科目，貸記“財政應返還額度”科目。
（二）非國庫集中支付方式下的基建核算
非國庫集中支付背景下開展會計核算活動過程中涉及到項目建設資金的撥款與項目資金的支出，收到撥款時，從會計處理層面看，既能夠反映出支出又能夠反映出撥款，其中借記“銀行存款”科目，貸記“預算撥款——項目支出”科目；若發生項目支出時，借記：“經費支出——項目支出”科目，貸記“銀行存款”科目。另外，依據行政單位核算要求，借記“固定資產”科目，貸記“固定基金”科目，這樣以來不僅能夠充分揭示出基建投資的實際狀況，而且還為編制基建項目竣工財務決算提供了信息支撐。至年度末，若將結余建設資金存入銀行賬戶中，并且不進行任何賬務處理，待項目竣工后，財政部門則可對結余資金進行收回處理，其中借記“預算撥款——項目支出”科目，貸記“銀行存款”科目。
特別注意的是待基建項目竣工后，若仍存在資金結余現象，則需要以專款專用原則為依據，由財政部門負責收回，并如數遞交至國庫中。
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