財政集中支付制度改革后，財政預算的執行方式也受到較大影響，為此必須提出相應對策。
財政集中支付制度實施對預算執行的影響有：
1、預算執行的規范性。權責發生制的實施，使預算信息更客觀真實，預算數據規范。
2、預算執行體系健全。在財政集中支付制度下，對原先的預算科目進行了相應的調整，另外一方面，在財務預算執行的過程中，還有一些相關的政策和措施，與國家當前實施的財務政策相對應，這樣，就讓財政集中制度下的財務預算規范化和制度化，這些新預算措施的調整和完善。
3.財政集中制度下的預算執行將更加適應社會發展的需求。財政集中支付制度下的預算執行的調整和完善。在很大程度上更能充分把相關預算執行落實到每個細節上，這樣可以更方便地進行核算和分析，這樣在財政集中支付制度下的預算執行將能更好地促進整個預算體系的進步與發展，創造出最大的經濟效益。
財政集中支付制度對預算執行對策：
(一)全面加強預算編制的指導與業務的培訓工作，增強預算執行的約束觀念
對財務預算執行的主體是人，當前社會又比較缺乏綜合素質相對完善的業務人員，加上在實際執行中，客觀上存在著很多業務人員專業素養比較低的情況，這就要求相關的財政部門需要對業務人員進行培訓指導。對在預算執行過程中有爭議或者意見不統一的地方就要進行集體協商和討論。盡可能的擴大協商的范圍與領域，爭取做到使整個的預算體制貼近實際發展的需要。另外在培訓的過程中，需要把專項培訓與日常培訓充分的結合起來，以達到理論與實踐并重的目的，即在進行專項培訓的時候對日常培訓進行鞏固和提高，而在進行日常培訓的時候對專項培訓進行深層次的拓展和深化。其達到的預期效果就是提高整個財務預算執行人員的整體素質和能力，實現整體利益的最大化。
(二)做好預算編制執行的基礎性工作，提高預算編制的科學性與完善性
對于這點需要從以下兩個方面進行具體分析。第一，要求全員參與。也就是說在整個預算執行的過程中，僅僅靠相關的財務執行人員是遠遠不夠的，同時也不能保障充分考慮到每個問題。這就需要全員參與，以保證能獲取到最全、最準確的信息。以便能為整個的預算執行提供充分的信息，進而提高預算執行的科學性、效益性與完善性。其次是進行項目庫的管理建設，對項目庫進行程序化管理。所謂項目庫就是預算資金的支出項目，對項目庫的建設也就是在進行項目審批的環節中，要嚴格把關，進行充分審核和論證，必須在項目得到完全確認的情況下，才可以實施，另外，整個項目庫的建設可以用來對所有的項目進行監督和審查，以保障項目實行的合理性。
(三)完善執行程序的設置，從系統上為預算執行提供一個技術性的保障
在進行相關項目申報和審批的程序上，應當科學細化，爭取做到與預算口徑保持統一。要嚴格按照預算執行的剛性和嚴肅性，所有的預算項目必須進行合理運算，對于已經超出預算或者將要超出預算的項目需要進行及時的調整和完善。以保證整體項目預算資金的穩定性，進而促進單位項目的正常運轉和執行。
(四)加強預算執行的監督，保證預算執行的嚴肅性和規范性
要想充分做到這一點，就需要對整個預算執行進行事前、事中以及事后的監督，而不是只對其中一個環節進行監督和完善。同時應在現有的監控系統的基礎上對每個環節都進行科學的監督，尤其是對現金支付業務，需要充分重視，以保障其使用的科學性和合理性。盡可能的做到及時發現問題，及時處理，以保證整體利益的實現。
