會計的產生早于稅收，但在稅收產生之后，會計與稅收就有了不解之緣。現代稅收離不開會計，離開會計的稅收是無法進行的，因為現代集團化企業的經營規模大、范圍廣，如果沒有會計的核算與監督管理，稅收就失去了準確的征收依據；現代會計也無法脫離稅收，因為稅收是為實現國家職能服務的，是具有強制性和無償性的。稅務機關代表國家要征稅，以保證國家的財政收入，企業要計稅、繳稅和進行稅務籌劃。以實現企業的稅收利益。稅收使征納稅雙方的利益連在一起，也使征納稅雙方不斷發生矛盾。
隨著社會主義市場經濟的建立。以及以所得稅為標志的稅收不斷法制化，企業會計的不斷規范化，特別是國家對會計行業進行的改革。使得會計準則、會計制度正逐步走向與稅法適當分離的道路。
一、財務會計與稅收產生差異的原因
(一)服務對象不同造成的目標不同
這是產生差異的根源。財務會計報告的目標是向財務會計報告使用者提供與企業財務狀況、經營成果和現金流量等有關的會計信息。稅收的取得必須依靠稅法來作為保障，而制定稅法的目標是規范稅收分配秩序，保證國家財政收入的實現，通過公平稅負為企業創造平等競爭的外部環境，并運用稅收這一經濟杠桿調節經濟活動的運行。由于會計與稅法的規范目的和出發點不同，如果我們強求會計準則與稅收法規一致，不利于正確反映企業的財務狀況和經營成果，況且。我國的稅收法規體系還處在健全之中，要使會計制度得以很好地貫徹，并與國際會計慣例趨同，必須遵循會計和稅收相分離的原則。既然會計與稅收的分離是納稅會計與財務會計分離的前提，那么納稅會計與財務會計的分離也是一種必然。分離是為了會計充分發揮自身的多重功能，例如財務功能、稅務籌劃功能、管理功能等。
納稅會計資料大多來自財務會計，在進行納稅調整、計算，并做納稅調整會計分錄后，再反映在會計賬簿和報告中，這就決定了納稅會計既要熟悉財務會計又要精通稅法。如何正確認識并處理好會計法規與稅法規定之間的差異，是廣大會計工作者、社會中介機構執業人員、稅務人員等面臨的一個現實而重要的問題。
(二)計量的標準、依據不同
稅法和會計制度最大的差別在于收益實現的時間和費用是否可抵扣，它又集中體現在會計原則與稅收原則的差別上。
1，稅收制度是收付實現制和權責發生制的混合，而企業會計制度堅持以權責發生制為原則。
2，新會計準則中規定會計計量屬性主要包括：歷史成本、重置成本、可變現凈值、現值、公允價值這五種方法，而歷史成本的客觀性和可驗證性是稅收征管的核心要素，所以稅法中歷史成本成了攝主要和最堅實的基石。只有堅持歷史成本原則，才能做到納稅有據可查，并有效約束計稅過程中的主觀性和隨意性，維護稅收的確定性原則。
3，會計核算中的配比原則是以權責發生制為基礎的，而稅法中的配比原則還需要同時遵循相關性原則和歷史成本原則。例如：稅法中贊助支出、擔保支出等視為與應稅收入不相關，因而規定不得在稅前扣除。
4，會計核算中的實質重于形式原則和謹慎性原則在稅法中并不采用。稅法對計稅依據、計稅方法的規定具有高度的剛性。它不容許摻雜主觀性的判斷或估計，否則稅收征管的隨意性現象就會滋生蔓延，納稅人利用其“判斷”延遲納稅，甚至不繳稅或者少繳稅的現象就難于遏制。所以我國稅法對諸如固定資產折舊年限、壞賬準備金可在稅前扣除的提取比例等等都作了嚴格規定。
二、納稅會計與財務會計分離的意義
以上只是列舉了會計和稅收中存在的主要差異，是大原則方面的差異，在實際工作過程中存在的細化差異以及需要進行的納稅調整更多，為了適應納稅人的需要，也是納稅人為了適應納稅的需要，納稅會計應該從財務會計中獨立出來。
納稅會計調整核算應該具有完備的理論體系，在進行納稅調整、計算，并做納稅調整會計分錄后，在納稅會計憑證和賬簿中記錄反映。這樣的調整結果更具有可驗證性，能提高納稅計算結果的正確性。有利于企業進行納稅籌劃，也有利于稅務機關的稽查工作。
三、納稅會計與財務會計的不同
(一)會計目標的不同
納稅會計的基本目標是遵守稅法規定，即達到稅收遵從(正確計稅、納稅、退稅等)，從而降低遵從成本。高層目標是向納稅會計信息使用者提供信息有助于其進行稅務決策、實現其稅收收益最大化。財務會計報告的目標。是向財務報告使用者提供與企業財務狀況、經營成果和現金流量等有關的會計信息，反映企業管理層受托責任履行情況，有助于財務報告使用者作出經濟決策。
(二)會計對象不同
納稅會計的對象是企業中能夠用貨幣計量的涉稅事項。財務會計的對象是能用貨幣表現的經濟活動，即企業的資金運動。
(三)會計核算不同
納稅會計的賬務核算是以財務會計為基礎的，納稅會計的調整過程主要有以下特點：
1，納稅會計不像財務會計在核算時有不同的會計政策可以選擇，它具有確定性，這是由稅法的強制性決定的。
2，納稅會計的調整分錄是在財務會計體系之外，不涉及財務會計有關賬簿，不對財務會計資料及核算結果產生影響。
3，對于時間性差異的調整分錄，年來不需要結轉，其余額直接結轉至下年度。對于永久性差異的調整分錄，年末需要結轉，余額為零。這是因為永久性差異不具有連續性，只對本期的納稅會計核算產生影響，對以后各期的納稅會計核算均無影響。而時間性差異具有連續性，對本期和以后各期的納稅會計核算均有影響。
