（一）審計主體的多樣性。高校重大科研項目的資助經費主要來源于國家財政專項撥款，其管理和使用應接受科技部、財政部以及項目依托單位主管部門等的檢查與監督。就目前所開展的“ 863”、“ 973”等國家重大科研項目的審計實踐來看，主要是由國家審計機關或由科技部條件財務司委托事務所實施外部審計。“橫向”項目主要由合作單位委托社會審計進行；另一方面，當前我國高校普遍設立了內部審計機構，高校內部審計的監管職能不斷加強，對重大科研項目的審計也應成為內審部門的重要職能。需要注意的是，內部審計與國家審計、社會審計均具有較強的監督制衡作用，但其作用層次、領域和方式是有差異的。內部審計的核心是對科研經費管理過程進行有效的、全面的監督，優勢體現在過程控制、實時控制，能夠有效克服“中間過程不問責”的弊端。然而，對于虛設課題騙取資金、改頭換面多頭申報等已超出單純科研經費管理范疇的問題，則應以國家審計監督為主導，內部審計主要起配合、協助的作用。
(二)審計客體的雙重性。科研項目的“項目依托單位”主要負責項目管理、經費財務管理和會計核算，審批大筆支出，監督課題組在其審批權限內的各項支出等。“課題組”是經費預算的執行者和項目任務的完成者，“項目負責人”則是課題組的人格化表現，對科研經費支出具有“財務一支筆”的權限，并對完成項目任務承擔法律責任。因此，在“課題制”管理模式下，審計對象包括 “項目依托單位”和“項目負責人”兩個層次。
(三)審計范圍的綜合性和專項性。高校無憂論文網重大科研項目的內部審計既要對科研經費的財務收支情況進行監督，又要對項目的經濟效益和社會效益進行評價，是一項較為復雜的綜合性審計。同時，它又是一項目標明確的專項審計工作，核心是對科研經費進行專項資金審計。大多數情況下，審計涉及的經費開支并不是很頻繁，因而可采用“詳細審計”的方式進行。
(四)審計依據的契約性。高校重大科研項目的內部審計除了要遵守 《審計法》、《財務會計準則》的基本要求外，還要以國家有關部門的相關法規作為依據。另外，重大科研項目在申請立項時要編制預算，且在“立項申請書”、“任務合同書”等相關文件中對研究任務、成果形式、技術與經濟指標、社會與經濟效益、完成期限、經費需求等都有著具體約定，可作為審計的主要依據。從這個特點來看，審計依據具有契約性。
(五)審計時限的多階段性。高校科研項目約定有執行期，科研項目的內部審計時限也以此為周期，而不一定與會計決算期一致。從內部審計與科研項目活動的時間先后來看，審計也不應該是一次性的，而應該貫穿整個項目實施過程。在項目前期準備階段要對經費預算、實施方案及合同等的制訂進行審計，在項目實施過程中要對費用預算執行、費用開支范圍等經濟活動進行審計，在項目完成后要對經費決算、合同執行情況進行審計。因此，高校重大科研項目審計是事前、事中、事后審計相結合的全過程控制的審計。上述特點決定了高校科研經費的內部審計工作具有“財務收支審計”、“預決算審計”、“效益審計”、“經濟責任審計”等綜合特征，且涉及部門眾多，是一項復雜的系統工程。
實踐中要注意遵循如下處理原則：
(一)與財務收支審計相結合。在開展審計工作時，財務收支審計為基礎。科研項目經費審計中仍然是采用查閱會計記錄，追蹤會計憑證、分析性復核等常用的方法，不過要注意兩點：一是高校一般都為申請的科研項目按負責人建立了專門的財務項目，審計查賬是以財務項目為主體的收入、支出及余額，而不是傳統的資產、負債及所有者權益科目；二是首先要理清科研經費資金的流向，一個項目經常是校內幾個教師共同申請的，而申請書上只有一個負責人，從主管單位到賬的科研經費分別進入了不同教師的科研經費財務賬戶，僅僅檢查項目負責人的賬戶無法反映到位資金的全部情況，我們只有通過杳找銀行賬戶，從資金的源頭查到資金分配，理清資金進入了哪些教師的財務項目，采用順查與逆查相結合的方式進行。
(二)與預算執行審計相結合。科研經費管理的核心是立項階段的經費預算，其特點是，將項目實施過程中所必需的費用都明確列入預算，這也是經費管理的難點。經費管理的關鍵是項目執行階段經費預算的嚴格執行，其特點是，被審查通過的預算成為合同執行的根本依據。科研經費審計中要結合預算審計方法，促使形成科學的預算方法、合理的預算體系及預算標準，使科研經費的審計規范化。
(三)與經濟責任審計相結合。由于科研經費審計客體具有雙重性的特點，即審計對象包括“項目依托單位”和“項目負責人”兩個層次。要通過審計評價科研經費使用的真實性、合法性、效益性情況，正確反映項目依托單位和項目負責人經費管理職能的履行情況。因此，科研經費審計具有經濟責任審計的特點，要與經濟責任審計方法相結合。
(四)與效益審計相結合。科研經費的使用效益是經費提供者最為關注的問題，也是衡量科研工作成效的重要標志。針對科研效益進行審計，必須建立相應的經費使用效益評價標準。效益性評價包括技術、經濟指標和社會效益等方面。技術指標的評價往往超出審計人員的專業范疇，而社會效益指標又往往定性描述居多，也不便于操作。所以對科研項目的效益審計難以建立有效的評價標準、程序，給開展這項工作帶來很大的難度。實踐中要利用當前效益審計研究的成果，在借鑒國內外先進的科研效益評價制度的基礎上，探索一條適合我國國情的科研經費效益評價體系。為使上述的處理原則成為實踐中可操作的具體辦法，必須形成系統、完善的內部審計程序。與一般情況類似，科研項目的內部審計程序也覆蓋審計準備、實施、報告編制三個階段，以下分別予以闡述。
（一）審計準備階段審計準備階段的主要工作是明確審計任務、確定審計項目、組織安排審計人員、編制審計方案。
1.合理確定審計項目。目前各高校科研項目呈現逐年上升的趨勢，很多的高校現階段只是開展了科研課題經費結題的審簽工作，可將科研項目審計安排為內部審計部門一項常規性的審計工作，依據內部審計力量，納入年度審計計劃中。目前高校科研項目審計尚處于起步階段，不能對所有項目進行審計，在選擇項目時要有重點地對重大的研究項目開展這一工作，如：國家大型的“ 863”、“ 973”等項目。對橫向項目只是考慮在合作單位有要求的情況下，依據其委托安排審計。
2. 組成審計組。根據科研項目的特點，安排審計人員組成審計組，由于科研項目審計涉及到一些專業性很強的工程技術領域，在必要時可以聘請相關領域的專家加入審計組。
3.收集背景資料，初步了解被審計科研項目及項目負責人基本情況。一是了解項目基本情況，獲取項目立項書、審批文件、經費預算書、合同文書、階段性考核及驗收材料等資料，重點了解項目性質、內容、合作單位、項目周期、合同簽訂情況、經費預算及來源、項目的推進計劃、完成情況及預期成果等；二是了解項目管理流程，及項目經費的劃撥及管理情況，向科研項目歸口管理部門詢問，獲取項目管理辦法，項目經費財務收支的會計資料及內部控制制度等資料：三是了解項目負責人基本情況，聽取項目負責人對項目經費管理情況的介紹，了解經費開支的審批權限、審批程序，及項目預算情況及實際執行中經費的增減變動等情況。另外，還要了解國家對項目管理方面的法律、法規、政策及管理辦法。
4.擬定審計方案，下發審計通知書。通知書的對象為項目經費的直接使用管理者，即課題組(或項目負責人)，同時抄送校內項目歸口管理部門、課題經費管理單位等。
（二）審計實施階段在審計實施階段，核心環節是建立相應的內控制度并對其執行情況進行測試，同時要對實質性測試的主要步驟加以規范。需要說明的是，對于所列舉的審計程序，在實際執行中可根據具體情況及專業判斷增加或減少相應的審計步驟。同時，為了提高審計效率，交易業務的實質性測試常常與控制測試同時進行。
1.內控制度的建立及執行情況測試由于科研項目的審計方法尚處于探索階段，在各高校初次實施這項審計工作時，可先單獨開展科研項目的內控制制度審計。通過對學校科研處、財務處、資產處、“研究所”、“實驗室”、“學院”等相關職能部門項目的內部控制制度建立及執行情況測試，評價上述部門的項目管理職能履行情況。這是事前預防的關鍵環節，是對項目的管理職能進行審計的重要程序，是完善監督管理機制的關鍵。
具體如下：(1)內部控制制度調研。對本校現有科研管理制度、辦法和基本情況進行調研，據此劃分業務循環，確定關鍵控制點，明晰審計軌跡，進行初步評價。(2)符合性測試。有針對性地選擇科研項目管理單位、項目所屬單位、課題組、項目負責人，通過向相關人員詢問、到現場觀察、穿行測試等方法，從收入管理、支出管理、實物資產管理、財務管理、合同管理、效益等幾個方面對科研項目內部控制制度進行符合性測試。(3)內部控制制度分析評價。
2.實質性測試學校財務管理部門一般針對每個科研項目都建立了經費財務卡片，分別反映每個項目的收入、支出及余額情況。按照確定的審計重點內容，對其進行實質性測試的主要步驟如下：(1)預算執行情況審計。經費管理的核心是預算及其執行，具體又包括經費來源預算執行情況審計、經費支出預算執行情況審計兩個方面。前者檢查預算收入是否及時、真實、完整到位。后者主要檢查：①審計檢查決算報表數與實際支出數是否與一致，有無直接以預算核定數列支的現象、有無預提成本的現象；②檢查所有支出項目是否嚴格按照任務合同書的經費預算范圍、標準執行；③檢查國家或學校有明文規定控制比例的費用，如項目管理費、人員費、協作費、業務費，其出是否與控制比例相符；④檢查重要支出是否合法、依據是否充分；⑤分析支出是否合理，是否為課題研究必須的支出；⑥審查經費使用中有無擠占、挪用、損失浪費問題，有無用于國家明文規定禁止的支出。目的在于檢查是否存在提供虛假配套承諾或不及時足額提供配套資金的問題，對預算支出的真實性、合法性進行監督，規范“項目負責人”的經濟行為，及時發現并糾正經費使用中存在的問題，提高科研經費的使用效益。(2)課題結余經費審計。
具體處理三方面的問題：第一，獲取項目結題信息，了解結題時間和結余經費的用途。第二，檢查結題后財務結賬時間，是否進行財務結算，是否長期掛賬報銷費用。第三，了解結題經費使用規定，檢查結賬經費的使用是否符合規定的用途。(3)資產管理審計。首先獲取或編制固定資產明細表，進而檢查固定資產的購置是否與預算相符、是否按照規定的購置程序、是否用于課題研究以及是否按照規定的用途使用，同時檢查課題研究過程中購置或試制形成的固定資產是否納入學校資產統一管理與核算、是否賬實相符且安全完整。另外，要注意對無形資產的審計。對課題研究形成的知識產權，要檢查其是否遵守有關管理辦法明確知識產權的歸屬，以及無形資產是否入賬等。(4)經費使用效益性審計。
主要依據是科研項目在任務合同書中明確了的各項技術、經濟及社會效益指標，如：創造的利潤、實現的產值、人才培養、論文發表數量、專利情況、獲獎情況等。具體需要獲取項目結題成果的相關指標數據，與任務合同書約定的目標或指標進行比較而做出判斷。效益中計的難點在于評價標準不好確定，特別是對于超出內審人員專業知識范疇的科研領域問題，要充分結合領域專家的意見，才能對效益性做出正確評價。3.審計報告編制階段完成上述審計程序后，整理工作底稿，編制審計報告。主要是對課題經費使用的真實性、合法性及效益性等相關問題發表審計意見。科研經費審計是高校內審工作的新領域，目前相關的理論和實證性研究尚處于起步階段，現有現成的系統性經驗可供借鑒。因此，該項工作的順利開展依賴于業內人士長期不懈的探索和努力，在堅持理論創新的同時還要進行大量的審計實踐。另一方面，高素質的內審專業人員隊伍，與科研領域專家的長效溝通機制，以及正確的審計觀念和良好的審計環境也是確保該項工作順利開展的必要條件，而這需要有關領導的高度重視和相關部門的大力支持才能得以真正實現。
!參考文獻：
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