“我國某省自實行財務管理信息化建設以后，財政非稅收收入從頭一年6個億人民幣上升為去年的80多個億，增幅13倍以上。”以部門預算、國庫集中支付、收支兩條線等為代表的改革逐步深入，完全打破了舊體制下的利益分配格局，改變了原有財政資金管理的模式，這不僅僅意味著國家財政管理體制的變化，更為廣大政府部門提升自身財務管理水平提出了更高的要求。三大難題
從國家實行改革開放的國策開始，我國的經濟管理體制就從長期的計劃經濟向市場經濟時代轉變。與之相應的是政府傳統計劃經濟相適應的行政管理職能向為市場經濟服務的政府服務職能轉變，這種職能的轉變要求以良好的經濟基礎為前提，它需要政府部門更有效地組織各種有效的資源來履行服務，而財務管理是政府組織經濟資源的重要內容，財務管理水平的高低直接影響到政府的行政管理能力。
然而，我國政府財務管理正面臨諸多的難題。
政府財務信息化建設水平參差不齊。目前政府財務會計電算化覆蓋率已經較高，但除部分地區外，其管理模式基本上處于核算會計階段，主要解決了單位基本收支數據的收集、統計和計算，尚未上升到管理會計的階段，不能為管理制度和措施的制定、實施和監管提供強有力的決策信息。
上級部門無法有效臨控下屬單位財務狀況。各級主管單位下轄單位眾多，在組織結構上，形成了一個相對比較復雜的塔型縱向組織。各單位財務系統相對孤立與封閉，無法滿足財務信息集中式管理的要求。而財務監控又受到時間、空間及人力方面的制約，無法實現上級單位對下級單位財務收支的監控。
不同政府部門間形成信息孤島，12金工程各自為戰。政府服務職能進一步加強后，各政府部門間的溝通聯系更加緊密，協同辦公需要增強。但是在傳統模式下，主管部門與下級單位之間，預算單位與財政部門之間，甚至同一單位內部不同業務部門之間，信息溝通困難，形成各種信息壁壘，管理措施難以有效落實，業務信息難以及時反饋到決策層。三個階段從80年代中期到目前為止，我國政府財務經歷了三個時代的發展。從最初的基本核算型階段發展到注重局部管理的管理型階段，再晉升為與電子政務融合的全面信息化階段。2004年政府財務管理全面信息化時代的浪潮席卷而來，宣布局部管理型財務軟件時代即將終結。由用友GRP掀起的這股洪流使政府財務信息化正以不可逆轉的趨勢向全面信息化時代飛速前行，并開創政府財務管理的新紀元。第三代政府財務管理全面信息化時代主要思想是將政府財務管理與電子政務有機融合，以財務為核心，加強政府預決算管理、資金管理，并與財政、內審、人事、行政、12金工程等電子政務工程有機結合，使政府財務信息化橫向拓展，并以集成的辦公門戶平臺實現財務部門與其他業務部門間的協同辦公。用友政務公司嚴紹業指出，“集中式財務管理是政府提升管理的需要，目前大部分地方政府從硬件網絡到計算機信息技術的認識與應用，都有了較大幅度的提高，電子政務基礎設施的建設為集中式財務管理的實現提供了有利的條件。”“三升”計劃但事實上，目前大部分政府部門的財務信息系統還停留在第二代甚至是第一代的基礎上，其軟件系統已經漸漸不能滿足日益精細化、全面化的政府財務管理工作需求。
因此，大部分政府財務信息化系統需要進行全面升級：實現從基礎到高端、從粗放到精細、從獨立到整體的三升計劃。首先，版本升級。從軟件系統上說，目前大部分政府財務部門使用的是通用軟件系統，這些系統普遍適用于企業單位，也可以用在政府財務管理當中。但這種通用軟件針對性不強，沒有反映政府財務管理工作的特質，在政府財務預算、決算、資金、國庫集中支付、非稅收入等方面都沒有相應的處理機制，或處理的專業性較差。為了滿足專業的政府財務管理工作，政府部門應該統一進行一次版本升級，將通用類財務軟件升級為專用的政府財務信息管理系統，實現財務工作的專業化。其次，模式升級。目前，大部分主管單位難以對下級單位進行有效監控，主要問題就是財務管理采用分散核算模式，數據不集中，造成監管難以有效落實。因此需要對政府財務的這種分散核算模式進行集中升級，應用“實時集中管理模式”或“分布集中管理模式”，從而實現財務數據的集中，使財務管理監督能夠有效執行。最后，管理升級。從管理角度出發，政府財務信息化系統應該上升到一個全新的高度，使其不僅要滿足各預算單位本身財務管理的需求，還必須滿足政府全面信息化管理的需求，使預算單位的財務與財政、門戶、人事、行政、辦公等系統有機融合，達到橫向拓展、縱向延伸的效果。這就要求政府部門搭建財務綜合辦公平臺，集成財政等眾多業務系統，以財務為核心創建政府財務監督內審應用和主管部門決策分析系統，使政府財務管理真正到達全面信息化的高度。
