對企業的對外投資業務所得稅處理的規定，財政部頒布的《企業會計制度》與國家稅務總局發布的《關于企業股權投資業務若干所得稅問題的通知》（以下簡稱《通知》）存在很大差異。為了正確計算企業的應納稅所得，需要明確企業的對外投資活動到底何時需要納稅。會計上分別按短期投資、長期股權投資、長期債權投資對企業的投資活動進行核算，核算的內容分為對初始投資成本的確認、計量和對投資賬面價值的調整兩大類，長期股權投資核算的方法按投資類型的不同分為成本法和權益法。
一、企業以非貨幣性資產對外投資有可能要納稅
短期投資和長期股權投資的初始投資成本是以投出的貨幣性資產金額或非貨幣性資產的賬面價值扣除已宣告發放的股利后的金額計量的。《通知》規定，當投資方以非貨幣性資產對外投資時，把它看做按公允價值銷售有關非貨幣性資產和投資兩項業務進行所得稅處理，并按規定計算資產轉讓所得或損失，從而增加當年的應納稅所得，并據此繳納所得稅。如果投出的資產轉讓所得數額較大，在一個納稅年度確認實現繳納所得稅確實有困難的，報經稅務機關批準，可作為遞延所得，在投資交易發生當期及隨后不超過五個納稅年度內平均攤銷到各年度的應納稅所得中。
二、投資方所得稅稅率高于被投資方時，分回的利潤需要補稅
不管企業的對外投資業務采用何種方法進行會計核算，《企業所得稅扣除辦法》及《通知》規定，被投資方會計上作利潤分配處理時，凡投資方適用的所得稅稅率高于被投資方適用的所得稅稅率的，除國家稅收法規規定的定期減免稅收優惠外，其取得的投資所得按規定還原為稅前收益后，并入應納稅所得，依法補繳所得稅。如果投資方投資于兩個以上的企業，并且這兩個企業的所得稅稅率不同，當投資方存在尚可在稅前彌補的虧損時，該企業可以選用對自己有利的方式計算補繳所得稅。即先用低稅率分回的利潤彌補虧損，再由較高稅率分回的利潤彌補虧損，最后用較高稅率分回的利潤計算應補繳的所得稅。
三、會計年度終了時，利潤表上的投資收益不一定都要納稅
在投資持有期間的會計處理，因為投資類別不同和核算方法不同，對投資收益的確認、計量也就不同，所以對應納稅所得的調整也有很大差別。如短期投資分得的現金股利以及按成本法核算的長期股權投資本年度分得的現金股利，在會計上都不確認為投資收益，而稅法上確認為投資所得，則應直接調增應納稅所得，并繳納所得稅。按成本法核算的長期股權投資以后年度分得的現金股利中有確認為投資收益的，要先從會計利潤中扣除這部分投資收益，再加上分得的現金股利，即可調整為應納稅所得。
按權益法核算的長期股權投資，年度終了時，要根據被投資方的盈利（或虧損）情況增加（或減少）投資收益和長期股權投資（減少時以賬面價值減為零為限）。當被投資方盈利時，投資方應在會計利潤基礎上按所確認的投資收益貸方發生額調減其應納稅所得；當被投資方虧損時，投資方按所確認的投資收益借方發生額調增其應納稅所得。投資方要進行這樣的調整是因為稅法上不承認權益法下投資方確認的投資收益，它要求投資方僅在下年度被投資方宣告發放股利時確認投資所得。
在投資持有期間的期末，會計上按謹慎性原則對短期投資計提短期投資跌價準備，對長期投資計提長期投資減值準備，對按權益法核算的長期股權投資攤銷其股權投資差額，這三項會計核算都對投資收益產生影響。稅法上不承認這部分影響。所以，應該按投資收益的借方發生額調增其應納稅所得，按投資收益的貸方發生額調減其應納稅所得。綜上所述，會計上核算的投資收益可能只作為納稅調整的依據，并不一定就要納稅。
四、企業轉讓或處置投資時不一定要納稅
在轉讓或處置投資時，會計上以所取得的轉讓收入扣除有關費用、計提的長期投資減值準備（或短期投資跌價準備）及未攤銷完的股權投資差額的剩余部分作為投資收益。稅法上在計算轉讓所得時，是以轉讓收入扣除轉讓費用及計稅成本。而計稅成本在以貨幣性資產投資時為其初始投資成本，在以非貨幣性資產投資時為其投出時的公允價值。故這種情況下應將會計利潤減去會計上確認的投資收益的貸方發生額，或加上投資收益的借方發生額，再加上按稅法確認的投資所得，計算出應納稅所得，并據此繳納所得稅。如果按稅法計算的投資所得為負數（虧損），可以在不超過當年實現的股權投資收益和投資轉讓所得中稅前扣除，超過部分可無限期向以后的納稅年度結轉扣除。
五、企業收到分派的股票股利時需要納稅
當被投資方宣告分派股票股利時，會計上投資方不作賬務處理，只在備查賬簿中登記該股票股數的增加量。但是，稅法上將被投資方分派的非貨幣性資產，包括股票股利，確認為投資所得。因此，應按股票的面值與所分得股數的乘積調增應納稅所得，并據此計算所得稅。
六、國債投資持有收益不納稅，但轉讓收益需要納稅加大企業的財務負擔，削弱企業的再籌資能力，大大增加企業的財務風險，極易造成企業的“藍字破產”。
這時，雖然企業有了稅收收益，但加大的財務風險又降低了企業的市場價值，不符合追求企業財富最大化的原則。因此，在稅收籌劃時，要運用風險與報酬的原理及差額分析法對每一納稅方案進行全面測算。
