從系統論和控制論的角度看，一個企業對其經營活動的控制是一個調節的過程，在調節過程中，筆者認為，必須注意處理好以下幾方面的關系：
一、正確處理內部控制與內部審計的關系
內部控制是由控制環境、會計系統和控制程序三個要素組成的，而內部審計是控制環境的一個特殊因素。內部審計是企業自我獨立評價的一種活動，它可以通過協助管理當局監督其他控制政策和程序的有效性，來促成好的控制環境的建立，為改進內部控制提供建設性意見。一般來說，內部審計在企業內部控制中占據特殊地位，內部控制的檢查與評價是通過內部審計來完成的。內部審計作為本企業最高管理層的代表，其主要職責是協助企業管理當局有效地履行其管理職責，對每個部門或每個分公司的內部控制進行監控。因此，內部審計人員必須獨立于被審部門或人員，并且必須直接向企業最高管理層負責并報告工作。可見，內部審計既是企業內部控制不可或缺的特殊因素，又監督著企業內部控制的運行。
二、正確處理常規控制與例外控制的關系
內部控制的主要控制對象是企業的常規業務活動，如果企業發生未預料事項或不常發生的事項，則現有的控制將會失去效力。常規控制與例外控制的關系，實際上就是內部控制中的一般授權與特殊授權的關系。其中，一般授權是對辦理常規性的經濟業務的權力、條件和有關責任者作出的規定，這些規定在管理部門中采取文件形式，或在經濟業務中規定一般性交易辦理的條件、范圍和對該項交易的責任關系。在日常業務處理中可以按照規定的權限范圍和有關職責自行辦理。特殊授權處理的是非常規性交易事項，比如，重大的籌資行為、投資決策、資本支出和股票發行等。特殊授權也可用于超過一般授權限制的常規交易。內部控制要求明確一般授權和特殊授權的責任和權限，以及每筆經濟業務的授權批準程序。企業的經濟業務既涉及企業與外單位之間資產與勞務的交換，也包括企業內部資產和勞務的轉移和使用。因此，每筆經濟業務都會有一系列內部相互聯系的授權批準程序。實踐證明，權力要受到制約，失去控制的權力很容易導致腐敗。
三、正確處理“硬控制”與“軟控制”的關系
企業的內部控制按控制的手段不同，一般分為“硬控制”和“軟控制”兩種類型。具體而言，硬控制指的是內部控制制度中那些“必須”的和“硬性”的規定，要求無論何時何地，也無論是誰，都必須遵守的規定。例如，實物盤點制度、定期對賬制度等，它客觀上規范和約束著會計人員及其他管理者的工作行為。而軟控制主要是指那些屬于精神層面的事物，如高級管理階層的管理風格、管理哲學、企業文化及內部控制意識等，它主要是靠理念、習慣、管理者的道德觀、價值觀等來維系，以發揮其作用。目前與企業以前的內部控制相比，更加強調軟控制的作用。為了有效地控制企業經營活動，實現其經營方針和目標，必須不斷提高企業管理者的綜合素質。因為企業內部控制執行的有效與否，主要取決于會計人員及其他管理者的自身素質及道德水準的高低，從這個意義上說，必須軟硬兼施，實行綜合控制，以期達到最佳控制效果。
四、正確處理好內部控制的靈活性、經濟性及簡便性的關系
企業控制系統應該具有足夠的靈活性，使其能夠適應不斷變化的環境，以滿足不同使用者的需要。同時，它也應該與企業內部的工作程序相協調。如果內部控制太剛性，就會抑制工作的進程，實際上是浪費時間和資金。內部控制的程序應簡單易懂。從其工作受到監控的人員角度看，不懂就意味著本身利益受到威脅；對管理人員來講，管理的信息需要用通俗易懂的方式來表達，這是十分重要的。一個難以理解的控制系統只會產生不必要的失誤、誤解。
五、正確處理會計控制與管理控制的關系
內部控制制度思想認為內部控制應分為內部會計控制和內部管理控制兩個部分。前者是指對會計記錄的可靠性有直接影響的內部控制，其目的是為了提高會計信息的質量，保護財產的安全與完整；后者是指對企業內部非會計性質的經營管理活動所實施的控制，其目的是貫徹經營方針、實現經營目標、提高經營效率、增加企業盈利。經過多年研究證實，這兩者是相互聯系、相互影響、不可分割的整體。會計控制是實現企業經營效益最大化目標的重要保證，只有經營效益目標得以實現，才能體現利用會計信息對資金流、物流，甚至作業鏈的會計控制過程的有效性。
